Kolokwium zaliczeniowe z modelowania homologicznego

Do z podanych poniżej sekwencji należy wybrać jedną i zaproponować dla niej model struktury przestrzennej.
Wymagane czynności:

znalezienie wzorca strukturalnego (kod PDB)
zestawienie wielosekwencyjne z członkami rodziny sekwencji
ręczne poprawienie alignmentu w SwissPDB Viewerze
zaproponowanie modelu cząsteczki zapisana w postaci projektu SwissPDBViewer (wzorzec, model, alignment)

A wynik modelowania w postaci Projektu SwissPDBViewer oraz plik z zestawieniem wielosekwencyjnym.
proszę wysłać na adres: ewas@amu.edu.pl

bardzo łatwy (na dostateczny)
Seq01
>seq01, 200 aa
PIISDDFKFQVWRKMFRALMPALEELTFDPSSAHP SLVVSSSGRRVECSEQKAPPAGEDPRQFDKAVAVVAHQQLSEGEHYWEVEVGDKPRWALG VIAAEAPRRGRLHAVPSQGLWLLGLREGKFLEAHVEAKEPRALRSPERRPTRIGLYLSFG DGVLSFYDASDADALVPLFAFHERLPRPVYPFFDVCWHDKGKNAQPLLLVGPEGAEA

Trudniejsza na ocenę dobrą
Seq02, 200 aa
>SEQ02, 200 residues
DIKLTVWKRLFRKVLPAPESLKLDPTTAHPLLELSKGNTVVQCGLLAQRRASQPERFDYS TCVLASRGFSCGRHYWEVVVGSKSDWRLGVIKGTASRKGKLNKSPEHGVWLIGLKEGRVY EAFSCPRVPLPVAGHPHRIGVYLHYEQGELTFFDADRPDDLRLLYTFQADFQGKLYPILD TCWHERGSNSLPMVLPLPSG

Trudniejsza na ocenę bardzo dobrą
SEQ3
>Seq03, xxx residues
MIVSSQVVLFSSISGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSERMELTVLYKEYADDD HIYQQKIKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSHLEALLEDGKELQRFKEVAAKSKDVLVSQGF TEFTIEDFHNTFMDLIEQVEKQTTVGELLGSFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRENKFF EHFIEGGRSIKEFCQQALNVSILVEYMDRGEGGTTNPHVFPEGSEPKVYLLYRPGHYDIL YK

Trudniejsza na ocenę bardzo dobrą
SEQ4
>Seq04, xxx residues
MENNSLKEQPVENTDVNQDELILQQQRRIEKEISESIALVGEKEPLKSLEQEYAEDDVYL SKAKALAQKYSYIRRTRPDGNCFFRAFSYAYLEKLIGNKDEYEKFRDLALKSKDSLVALG FPQFTVEDFHDTFMEVIDKVGGSDTDSSHMELHKLFNEQGYSDYVVVYLRLITSGQLQRD ADFYQHFIEGERTISEFCHQEVEPMYKESDHIHIIAMSSALGTGVRVRYMDRGAGTEVTA HDFPEGAIPAVHLLYRPGHYDILYP